慈濟大學醫學系系學會組織架構

行政部門目前設有會長一名，副會長三名，執行秘書一名。
下設活動、體育、器材、資訊、學術、國事、文宣兼系刊白燈塔、總務共八部門；
監察委員會設監事主席與副監事主席各一名、各年級監事委員三名。