慈濟大學醫學系系學會組織架構

理事會設有會長一名、副會長三名、國事長二名及執行秘書一名。
下設活動、體育、器材、資訊、學術、國事、文宣兼系刊白燈塔、總務；
監察委員會設監事主席一名、各年級監事委員三名。